Γεννημένο σε εργαστήριο γενετικής. Κατασκευασμένο για τα πάντα.
Το Zyrkel ξεκίνησε στο Ινστιτούτο Ανθρώπινης Γενετικής στο UKE Αμβούργο. Το αρχικό πρόβλημα ήταν απλό: οι γονιδιωματικές αγωγές είναι πολύπλοκες, οι παράμετροι αλλάζουν μεταξύ συνόλων δεδομένων, οι εργασίες SLURM εκτελούνται στις 3 τα ξημερώματα — και οι περισσότεροι φοιτητές και ερευνητές δεν ξέρουν προγραμματισμό. Τα εργαλεία βιοπληροφορικής πρέπει να είναι προσβάσιμα σε όλους στο εργαστήριο, όχι μόνο στο ένα άτομο που ξέρει Python. Έτσι κατασκευάστηκε ένα σύστημα που μηδενίζει αυτό το εμπόδιο: πείτε του τι χρειάζεστε, και αναλαμβάνει τα υπόλοιπα. Θυμάται κάθε παράμετρο, κάθε αποτέλεσμα, κάθε μάθημα.
Στη συνέχεια, το σύστημα μνήμης γενικεύτηκε. Προστέθηκαν εργαλεία — όχι μόνο για γονιδιωματική, αλλά για τα πάντα. Εμφανίστηκε μια επικάλυψη επιφάνειας εργασίας που μπορούσε να διαβάζει την οθόνη και να απαντά σε πλαίσιο. Ακολούθησε η φωνή. Μετά ήρθε η δυνατότητα που άλλαξε τα πάντα: συνδέστε ένα Zyrkel σε δύο προγράμματα που δεν έχουν κοινό API, και επικοινωνούν μέσω αυτού. Μετά ήρθε το σύστημα στόλου — ένα Zyrkel έγινε δύο, μετά δέκα, μετά εκατοντάδες, καθένα εξειδικευμένο, καθένα μαθαίνει ανεξάρτητα, όλα συντονισμένα.
Σήμερα, ένα μόνο δυαδικό αρχείο 25MB — ή ένας στόλος χιλιάδων — τρέχει στον φορητό σας, στο HPC cluster σας ή στην υποδομή Kubernetes σας. Χειρίζεται ταξινόμηση γονιδιωματικών παραλλαγών και υπολογιστικά φύλλα Excel. Παρακολουθεί παλμούς καρδιάς και γράφει email. Δημιουργεί ιδέες και τις εκτελεί αυτόνομα. Είναι μια γνωστική μονάδα που συνδέεται όπου χρειάζεται.


